Les missions opérationnelles de l'ERA sont principalement définies par le règlement (CE) n°881/2004 et le nouveau règlement de l'ERA, qui pourrait faire apparaître de nouvelles missions non encore prévues lorsqu'il sera adopté, en particulier en ce qui concerne l'ETCS.
De operationele taken van het ERA worden in ruime mate gedefinieerd door Verordening (EG) nr. 881/2004 en de nieuwe ERA-verordening waaruit onvoorziene bijkomende taken kunnen verrijzen als de verordening wordt goedgekeurd, vooral met betrekking tot ERTMS.