Conformément à l'exercice d'étalonnage des performances des politiques nationales en matière de RDT qui est mené actuellement par la Commission comme cela a été recommandé lors du Conseil européen de Lisbonne, la valeur ajoutée générée par les activités de ce programme, mais aussi les problèmes rencontrés lors de leur mise en œuvre, devraient être régulièrement évalués sur la base d'indicateurs adéquats et d'une méthodologie cohérente qui renforceraient l'objectivité et étendraient l'acceptation de la procédure d'évaluation.
Volgens de benchmarkingsmethodiek van het nationale OTO-beleid dat thans door de Commissie wordt uitgevoerd, zoals aanbevolen door de Europese Raad van Lissabon, moeten de toegevoegde waarde van de activiteiten van dit programma, maar ook de problemen bij de uitvoering regelmatig volgens passende indicatoren en met een consistente methodologie worden geëvalueerd, waardoor de objectiviteit zal verbeteren en het evaluatieproces gemakkelijker wordt geaccepteerd.