Ook de invoer van agrobrandstoffen moet gepaard gaan met een dergelijke certificering, willen de voordelen voor het klimaat van vervanging van fossiele brandstoffen niet volledige teniet worden gedaan door de toegenomen CO2-emissie ten gevolge van ontbossing.
Entsprechende Zertifizierung ist zudem ein wichtiges Element, das die Einfuhren von landwirtschaftlich erzeugten Kraftstoffen flankiert, damit die klimapolitischen Vorteile der Ersetzung fossiler Brennstoffe nicht durch mehr CO2-Emissionen als Folge des Abbaus der Wälder in das krasse Gegenteil verkehrt werden.