Elke regeling waarbij de luchtvaart in het algemene ETS wordt geïntegreerd, moet rekening houden met de beschermde status van de sector en aangepaste voorwaarden scheppen, bijvoorbeeld een beperking van het aantal emissierechten dat de luchtvaartsector op de markt mag kopen (om marktverstoring ten nadele van minder beschermde sectoren te vermijden) en de vereiste om een deel van de noodzakelijke emissieverminderingen zonder handel te realiseren vooraleer rechten mogen worden gekocht.
Jede Vereinbarung zur Einbeziehung des Luftverkehrs in ein weiteres ETS müsste den geschützten Status dieses Sektors berücksichtigen und entsprechende Bedingungen vorsehen, z.B. eine Obergrenze für die Zahl der Emissionsrechte, die der Luftverkehrssektor auf dem Markt erwerben könnte (um eine Marktverzerrung gegenüber weniger geschützten Sektoren zu vermeiden) sowie die Verpflichtung, dass der Luftverkehr einen Anteil der erforderlichen Reduzierungen durchführen muss, bevor er Emissionsrechte erwirbt.