Als gevolg van de sterke nadruk die bij de nanotechnologie op kennis ligt, rijzen er fundamentele vragen over wat wel en wat niet octrooieerbaar dient te zijn (bijvoorbeeld op het niveau van individuele moleculen).
Da sie hohe Ansprüche an Kenntnisse stellt, wirft die Nanotechnologie die grundlegende Frage auf, was patentiert werden sollte und was nicht (z.B. bei einzelnen Molekülen).