A aplicação desta directiva continua a ser incompleta em alguns Estados-Membros e as tendências em matéria de poluição variam consideravelmente na União Europeia.
A política da União Europeia no domínio da água é constituída por um conjunto de outras directivas que incluem as directivas sobre as águas balneares, as águas subterrâneas e a água destinada ao consumo humano, bem como as futuras directivas sobre o meio marinho e a gestão das inundações, que se encontram na fase de proposta do processo de decisão.