ECHO heeft ondersteunende bureaus in de Soedanese hoofdstad Khartoem, in Nyala in Darfur, in Juba in Zuid-Soedan, in Abéché in Oost-Tsjaad en in de hoofdstad van Tsjaad, Ndjamena.
ECHO besitzt Außenstellen in der sudanesischen Hauptstadt Khartum, in Nyala in der Region Darfur, in Juba im Süden des Sudan, in Abéché im Osten des Tschads und in der Hauptstadt N'Djamena.