Op het verloop van de onderzoeken zijn met name de bepalingen van toepassing van artikel 5, 6 en 9 van de Verordeningen (EG) nr. 1073/1999 en (Euratom) nr. 1074/1999. Op grond daarvan heeft de directeur van het Bureau een verantwoordelijkheid bij elke wezenlijke fase van het onderzoek (opening, uitvoering, verslag naar aanleiding van het onderzoek en follow-up van onderzoeken).
Der Ablauf der Untersuchungen ist im Wesentlichen durch die Artikel 5, 6 und 9 der Verordnungen (EG) Nr. 1073/1999 und (Euratom) Nr. 1074/1999 geregelt, die dem Direktor des Amtes eine Zuständigkeit in jeder wichtigen Phase einer Untersuchung (Einleitung, Durchführung, abschließender Untersuchungsbericht und Follow-up) zuweisen.