The program was the focus of some controversy in its early days, since Transport Canada, assisted by the Royal Canadian Mounted Police (RCMP) and the Canadian Security Intelligence Service (CSIS), adds names to the list without the knowledge or consent of the potential passengers.
À ses débuts, le Programme était controversé, car Transports Canada, de concert avec la Gendarmerie royale du Canada et le Service canadien du renseignement de sécurité, ajoute des noms à la liste sans que les passagers éventuels soient au courant ou y consentent.