Basically, if he feels strongly enough, the deputy minister has a formal mechanism that protects his position and puts the matter into the political minister's arena, where the political minister, in writing, has to then assume responsibility, accountability, and answerability to all three of these areas.
En gros, s'il juge la chose assez sérieuse, le sous-ministre se sert d'un mécanisme formel qui sert à protéger son poste. La question est présentée au ministre qui répond alors par écrit, prenant ainsi à son compte la responsabilité, la responsabilisation et la reddition de comptes.