Les principales souches d'Histoplasma capsulatum, Coccidioides immitis, Candida spp., Blastomyces dermatitidis, Rhodotorula, Cryptococcus neoformans, Sporothrix schenckii, Mucor mucedo et Aspergillus fumigatus sont inhibées in vitro par des concentrations d’amphotéricine B variant entre 0,03 et 1,0 µg/ml.
De meeste stammen van Histoplasma capsulatum, Coccidioides immitis, Candida spp., Blastomyces dermatitidis, Rhodotorula, Cryptococcus neoformans, Sporothrix schenkii, Mucor mucedo en Aspergillus fumigatus worden in vitro geremd door amfotericine B-concentraties van 0,03 tot 1,0 µg/ml in vitro.