Lors des études cliniques sur l'acétate de mégestrol chez les patients présentant le syndrome d'immunodéficience acquise, globalement, il n'y a pas eu de différence statistiquement significative entre le traitement actif et le traitement placebo chez les patients présentant au moins un effet indésirable.
Tevens werd melding gemaakt van benauwdheid, pijn, hartinsufficiëntie, hypertensie, opvliegers, humeurschommelingen, cushingoïde facies (moonface), verergering van tumorproliferatie (al dan niet met hypercalcemie), hyperglycemie, alopecia, carpaal tunnel syndroom, diarree, lethargie en huiduitslag. Tijdens onderzoek naar megestrolacetaat bij patiënten met een bestaande immuundeficiëntie werden geen significante statistische verschillen geconstateerd tussen de actieve behandeling en de placebobehandeling bij patiënten die minstens een van de bijwerkingen vertoonden.