En cas de passage systémique, l’excrétion de la chlorhexidine est rénale ou biliaire, sans métabolisation préalable ; sa demi-vie est de 4 jours environ.
Bij systemische inname wordt chloorhexidine uitgescheiden via de nieren of via de gal, zonder voorafgaande metabolisatie. De halfwaardetijd bedraagt ongeveer 4 dagen.