Pour prélever l'échantillon de tissu, le médecin peut utiliser divers instruments: aiguille creuse, pince, etc. Pour les organes creux comme le côlon, la vessie, l’estomac ou les bronches, il recourt souvent à un endoscope, auquel est fixé un petit instrument chirurgical.
De arts kan diverse instrumenten gebruiken om een weefselmonster (biopt) te nemen, zoals een holle naald, een chirurgisch pincet enz. Voor de holle organen, zoals de darmen, de blaas, de maag en de bronchiën gebruikt hij vaak een endoscoop.