Le ganciclovir-triphosphate exerce son activité antivirale par le ralentissement de la synthèse d'ADN viral de deux manières : inhibition compétitive de l'ADN-polymérase virale et incorporation directe dans l'ADN viral, ce qui empèche son allongement ultérieur.
Ganciclovir-trifosfaat oefent zijn antivirale werking uit door de synthese van het virale DNA af te remmen op twee manieren: competitieve inhibitie van het virale DNA-polymerase en directe innesteling in het virale DNA waardoor verdere verlenging wordt verhinderd.