La polymyxine B a une action de surface avérée; par ses éléments moléculaires lipophiles et hydrophiles, cette substance provoque une modification au niveau de la structure membranaire des bactéries, en se plaçant dans la couche lipoprotéique de la membrane cytoplasmatique, ce qui entraîne la disparition de la semi-perméabilité de la membrane et, dès lors, la destruction de la cellule.
Polymyxine B heeft een uitgesproken oppervlakte-actieve werking; dankzij zijn hydrofiele en lipofiele moleculaire bestanddelen brengt deze stof een wijziging teweeg in de structuur van de membraan van de bacteriën, door zich in de lipoproteïnenlaag van het cytoplasmamembraan te plaatsen. Daardoor verdwijnt de semi-permeabiliteit van de membraan hetgeen de vernietiging van de cel tot gevolg heeft.