Le phosphate de clindamycine est transformé en clindamycine (molécule mère active) dans la peau. La clindamycine elle-même est métabolisée, principalement dans le foie, par N- déméthylation, sulfoxydation et hydrolyse, et est excrétée en majeure partie dans la bile.
Clindamycinefosfaat wordt in de huid omgezet tot clindamycine, terwijl het clindamycine zelf via N-demethylering, sulfoxidatie en hydrolyse primair in de lever wordt omgezet en voornamelijk in de gal wordt uitgescheiden.