Le diagnostic peut être confirmé par l'observation endoscopique d'une colite pseudo-membraneuse ou par la mise en évidence de Clostridium difficile et des toxines dans les selles.
De diagnose kan bevestigd worden door het endoscopisch aantonen van pseudomembraneuze colitis, of door de aanwezigheid van Clostridium difficile en toxines in de stoelgang.