Un avantage majeur de l’IRM (quel que soit du reste le type d’appareil) est que, contrairement aux radiographies et CT-scans, cet examen n’expose pas le patient aux rayons ionisants.
De scanners maken ook minder lawaai en zijn goedkoper dan de klassieke, ‘grote’ MRI’s. Een belangrijk voordeel van alle MRI’s is dat ze de patiënt niet blootstellen aan schadelijke röntgenstralen, wat met de gewone radiografieën en CT-scans wel het geval is .