Par ailleurs, la conservation dans les banques de gènes est confrontée à un certain nombre de paramètres qui compromettent l'efficacité de la conservation ex situ : choix des méthodes de collecte des échantillons, choix des ressources génétiques à collecter, choix des accessions à multiplier et limites des activités de régénération, nombreuses méthodes de gestion des bases de données et problème des duplicatas, insuffisance du personnel de gestion et du budget qui est alloué aux travaux de conservation.
Bovendien zijn er bij de instandhouding in genenbanken bepaalde parameters in het spel die de doeltreffendheid van de instandhouding ex situ kunnen schaden: keuze van de methodes voor het verzamelen van monsters, keuze van de te verzamelen genetische hulpbronnen, keuze van de te vermeerderen aanwinsten en grenzen van de regeneratieactiviteiten, het grote aantal methodes voor het beheer van databanken en het probleem van dubbel werk, gebrek aan beheerspersoneel en te geringe middelen voor instandhoudingswerkzaamheden.