Le protocole de Kyoto concerne le dioxyde de carbone et son effet sur le réchauffement de la Terre et dès lors son impact sur le climat, alors que le protocole de Göteborg a trait au dioxyde de soufre, aux oxydes d'azote, à l'ammoniaque et aux matières organiques volatiles, ainsi qu'à leur rapport avec l'acidification, l'eutrophisation et la formation d'ozone.
Kyoto heeft betrekking op koolstofdioxide en de invloed ervan op de opwarming van de aarde en dus van het klimaat, terwijl het Göteborg-protocol betrekking heeft op zwaveldioxine, stikstofoxiden, ammoniak en vluchtige organische stoffen, en de relatie ervan tot verzuring, eutrofiëring en ozonvorming.