Le fait que la politique étrangère et de sécurité commune, qui est régie au sein de l'Union par une méthode essentiellement intergouvernementale (2 pilier) puisse être financée par le budget communautaire (1 pilier) a, dans le passé, suscité certaines tensions entre le Conseil et le Parlement européen.
Het feit dat het gemeenschappelijk buitenlands en veiligheidsbeleid, een gebied waarop binnen de Unie hoofdzakelijk een intergouvernementele methode wordt toegepast, (2de pijler) gefinancierd wordt met de begroting van de Europese Gemeenschappen (1ste pijler) zorgde in het verleden soms voor spanningen tussen de Raad en het Europees Parlement.