Le CCA portugais prévoit des groupes thématiques pour le suivi des matières horizontales recoupant les différents programmes opérationnels: environnement, égalité de chances, société de l'information, PME / compétitivité / innovation / qualification, ressources humaines, santé et transports.
Met het oog op de horizontale onderwerpen van de verschillende operationele programma's voorziet het Portugese CB in themawerkgroepen voor de volgende thema's: milieu, gelijke kansen, informatiemaatschappij, MKB / concurrentievermogen / innovatie / kwalificatie, menselijk potentieel, gezondheid en vervoer.