Une fois la procédure de conciliation officiellement ouverte, les deux thèmes les plus controversés restaient le financement des mesures de sûreté aérienne et la question des dispositions relatives à la comitologie qui avait été soulevée au cours de la procédure.
Bij de formele opening van de bemiddelingsprocedure waren de financiering van de veiligheidsmaatregelen in de luchtvaart en, zoals tijdens de procedure was gebleken, de comitologiebepalingen nog steeds de meest omstreden punten.