De fortes disparités régionales peuvent également exister au sein d'un même pays: en RDC, par exemple, la prévalence du VIH fluctue autour de 5 % dans la région du Kasaï oriental, alors qu'elle est de 1,4 % à l'échelle nationale.
Ook binnen een land kunnen er sterke regionale verschillen zijn; in de regio Oost-Kasaï in DR Congo, bijvoorbeeld, schommelt de hiv-prevalentie rond de 5 %, terwijl de nationale hiv-prevalentie 1,4 % is.