L'octroi de microcrédits comporte des coûts opérationnels plus élevés, en raison du volume peu important des prêts, du manque de garanties (suffisantes) et de frais administratifs élevés, étant donné qu'il est souvent difficile de joindre physiquement les clients, et la nécessité de services approfondis de soutien aux entreprises et de conseils – ces caractéristiques requièrent généralement un réseau large et coûteux de personnes proches du groupe cible.
Het verlenen van microkrediet brengt hogere werkingskosten met zich mee, doordat de leningen kleiner zijn, er geen of onvoldoende garanties zijn en de behandelingskosten hoog oplopen, aangezien het vaak moeilijk is de cliënten te bereiken en er behoefte is aan voldoende bedrijfsondersteunende diensten en advies. Hierdoor is er doorgaans nood aan een uitgebreid en duur netwerk van personen die dicht bij de doelgroep staan.