La majeure partie des financements de l’UE est allouée sur la base d’appels à projets concurrentiels, mais le budget prévu pour le programme Horizon inclut aussi le financement du Centre commun de recherche, le service scientifique interne de la Commission européenne, de l’Institut européen d'innovation et de technologie ainsi que de la recherche effectuée au titre du traité Euratom.
Het grootste deel van de EU-onderzoeksfinanciering wordt toegekend op basis van vergelijkende oproepen tot het indienen van nieuwe voorstellen, maar het budget voor Horizon omvat ook financiering voor het Gemeenschappelijk Centrum voor Onderzoek, de interne wetenschappelijke dienst van de Europese Commissie; het Europees Instituut voor innovatie en technologie en onderzoek dat wordt uitgevoerd in het kader van het Euratom-Verdrag.