L'administrateur général, sous l'autorité du président, assure la direction effective du Comité supérieur de contrôle, sous la surveillance du ministre qui a le Comité dans ses attributions, et est donc responsable de l'organisation et du fonctionnement interne, en ce compris la gestion du personnel, sa carrière, ses affectations internes et la discipline (sauf en ce qui concerne les missions judiciaires).
Onder het gezag van de voorzitter geeft de administrateur-generaal dus leiding aan het Hoog Comité van Toezicht onder het toezicht van de minister tot wiens bevoegdheid het HCT behoort. Hij is dus verantwoordelijk voor de organisatie en de interne werking met inbegrip van het personeelsbeheer, hun loopbaan, hun interne benoeming en het tuchtreglement (behalve wanneer het om gerechtelijke opdrachten gaat).