L'EEE repose sur des objectifs bien définis, à savoir une meilleure coordination des politiques de recherche, l'élimination de la fragmentation qui caractérise actuellement les équipes et les infrastructures de recherche, la promotion de la mobilité, et l'ouverture des systèmes non encore coordonnés, en termes tant géographiques que thématiques.
De Europese Onderzoekruimte is gebaseerd op welbepaalde doelstellingen, namelijk een betere coördinatie van het onderzoekbeleid, eliminatie van de fragmentering waardoor onderzoekteams en infrastructuur thans worden gekenmerkt, de stimulering van mobiliteitsprogramma's, en het openstellen van systemen welke thans zowel geografisch als thematisch ongecoördineerd zijn.