Tout en bénéficiant de l'expérience d'autres programmes communautaires, comme PHARE, et tout en ayant été conçu selon le schéma désormais testé du Fonds de cohésion, ISPA a connu une phase initiale plutôt lente et problématique.
Hoewel ISPA gebruik kon maken van de ervaringen van andere communautaire programma's zoals Phare en is gemodelleerd naar het beproefde schema van het Cohesiefonds, is het programma maar langzaam van de grond gekomen en heeft het nogal wat problemen opgeleverd.