Amnesty International a fait à plusieurs reprises état de ses préoccupations à l'égard de la partie 4 de la loi anti-terroriste, arguant qu'elle crée un système de justice pénale fantôme, qui se soustrait à un certain nombre d'éléments et de garde-fous essentiels, qui existent à la fois dans le système d'incrimination pénale ordinaire et dans les procédures nationales de définition du statut de réfugié.
Amnesty International heeft herhaaldelijk zijn verontrustheid uitgesproken dat deel 5 van de ATCSA een schaduwsysteem voor het strafrechtelijke systeem heeft gecreëerd, dat een aantal cruciale onderdelen en waarborgen van het normale strafrechtelijke systeem en de nationale procedures voor de bepaling van de vluchtelingenstatus mist.