Les relations entre l'EIE et régimes de contrôle environnementaux nationaux sont complexes et il semble n'y avoir que peu de coopération réelle entre la directive EIE et d'autres directives telles que les directives « PRIP » et « habitats ».
De relatie tussen de m.e.r.-procedure en nationale regelingen voor milieubescherming is complex en er lijkt maar weinig sprake van echte coördinatie tussen de uitvoering van de m.e.r.-richtlijn en de uitvoering van andere relevante richtlijnen, zoals de IPPC- en de Habitatrichtlijn.