Le développement d'armes nucléaires est cependant une autre affaire et, même si l'accord cadre ne renferme aucune référence spécifique à des installations nucléaires autres que les réacteurs modérés au graphite existants et prévus (une telle référence existe peut-être dans un "protocole secret"), il est clair que le développement d'armes nucléaires remettrait en cause tout le processus de la KEDO.
De verdere ontwikkeling van kernwapens is echter een andere zaak, en hoewel in de overeenkomst niet specifiek wordt gesproken over andere dan de bestaande en de geplande grafietgemodereerde reactoren (mogelijk wordt hierover wel gesproken in een "geheim protocol"), is het duidelijk dat enigerlei activiteit op het gebied van kernwapenontwikkeling het gehele KEDOproces ondermijnt.
