Une hypothèse récente du professeur Prusiner, qui a reçu le prix Nobel pour ses recherches sur le prion, tendrait à démontrer qu'un mouton peut avoir été contaminé par plusieurs souches de prions simultanément (scrapie et ESB), et qu'en raison de la plus grande sensibilité à la chaleur de ces souches de scrapie lors du processus de production des farines animales faites à partir de moutons contaminés, la souche d'ESB aurait été épurée et aurait ainsi pu être plus facilement transmise aux bovins.
Een recente hypothese van professor Prusiner die de Nobelprijs kreeg voor zijn priononderzoek, zou erop wijzen dat een schaap met verschillende prionenstammen (scrapie en BSE) tegelijkertijd kan zijn besmet, en wegens de grotere hittegevoeligheid van deze scrapie-stammen bij het productieproces van diermeel van besmette schapen, deze BSE-stam zou zijn uitgezuiverd en aldus gemakkelijker op runderen kon worden overgebracht.