Cette vaste structure inclut donc le Conseil de transition du Kosovo, qui devient l'organe consultatif suprême de la JIAS, le Conseil consultatif intérimaire, qui sert à la fois de cabinet au RSSG et d'organe exécutif à la JIAS, ainsi que 20 départements administratifs, placés chacun sous la responsabilité conjointe d'un ressortissant kosovar et d'un représentant de la MINUK.
De structuur omvat de overgangsraad voor Kosovo (Kosovo Transitional Council - KTC), het grootste adviesorgaan van JIAS, de tijdelijke adviesraad (Interim Advisory Council - IAC) die de SRSG adviseert en als uitvoerend orgaan voor JIAS optreedt, en 20 administratieve departementen, elk onder een tweehoofdige leiding, een Kosovaar en een UNMIK-functionaris.