Deze belemmeringen verhinderen op dit moment dat ideeën snel op de markt worden gebracht. Het Innovatie-Unie-plan streeft eveneens naar een radicaal andere manier van samenwerken tussen de overheidssectoren en de private sectoren, met name via innovatiepartnerschappen tussen de Europese instellingen, de nationale en regionale autoriteiten en het bedrijfsleven.
Zudem soll sie die Zusammenarbeit von öffentlichem und privatem Sektor völlig neu gestalten, insbesondere durch Innovationspartnerschaften zwischen den europäischen Einrichtungen, nationalen und regionalen Behörden und privaten Unternehmen.