Terwijl de gemeenschappelijke organisatie van markten onderworpen is aan mededingingsregels, zijn er bepaalde uitzonderingen om te zorgen voor het goede functioneren van het beleid en het behalen van de EU-doelstellingen (bijv. gezamenlijke voorzieningen voor de opslag, de behandeling of de verwerking van visserij- en aquacultuurproducten).
Die gemeinsame Marktorganisation unterliegt zwar Wettbewerbsregeln, es bestehen jedoch gewisse Ausnahmen, um gewährleisten zu können, dass die Strategie wie geplant funktioniert und die Ziele der EU erreicht werden (z. B. gemeinsame Einrichtungen für die Lagerhaltung oder die Be- oder Verarbeitung von Fischerei- und Aquakulturerzeugnissen).