Er bestaan momenteel twee verschillende procedures voor de registratie van geneesmiddelen, namelijk de zogenaamde gecentraliseerde procedure, die onder het beheer staat van het Europees Bureau en waarbij een vergunning wordt verleend voor alle lidstaten van de Unie, en daarnaast de zogenaamde procedure inzake wederzijdse erkenning, die onder de lidstaten ressorteert.
Derzeit bestehen zwei Registrierungsverfahren für Arzneimittel: das so genannte zentralisierte Verfahren im Rahmen der Europäischen Agentur, die eine Genehmigung für alle EU-Mitgliedstaaten bewirkt, und das so genannte Verfahren der gegenseitigen Anerkennung, das in der Zuständigkeit der Mitgliedstaaten liegt.