Bocklet bleef tot 1993 Europarlementariër. Een jaar later werd hij gekozen tot lid van het Beiers Parlement en ging hij de functie van minister van Voedselvoorziening, Land- en Bosbouw bekleden. Sinds 1998 is hij minister van federale en Europese zaken.
1994 wurde er in den bayerischen Landtag gewählt. Er war Bayerischer Staatsminister für Ernährung, Landwirtschaft und Forsten und ist seit 1998 Staatsminister für Bundes- und Europaangelegenheiten.