In de EU doen zich echter ook endogene problemen voor in de onlinehandel, bijvoorbeeld de geografische versplintering van de markten, de aan de distributieketens opgelegde conventionele beperkingen, het ontbreken van een gemeenschappelijk belastingstelsel, het bestaan van regelgeving die de traditionele distributiepraktijken in stand houdt en begunstigt.
Dennoch gibt es in der EU inhärente Probleme, die die Abwicklung von Online-Handelsgeschäften beeinträchtigen, beispielsweise geografische Marktaufteilung, Auferlegung vertraglicher Einschränkungen für Vertriebsnetzwerke, das Fehlen eines gemeinsamen Steuersystems und die Existenz regulatorischer Rahmenwerke, die traditionelle Betriebspraktiken erhalten und favorisieren.