Lidstaten leggen deze richtlijnen ten uitvoer door middel van maatregelen zoals belastingvrijstellingen voor biobrandstoffen, verplichtingen inzake biobrandstoffen voor brandstofleveranciers, feed-in-tarieven voor producenten van elektriciteit uit hernieuwbare energiebronnen en groenestroomcertificaten.
Die Mitgliedstaaten setzen diese Richtlinien durch verschiedene Maßnahmen um, wie etwa Steuerbefreiungen für Biokraftstoffe, Biokraftstoffverpflichtungen für Brennstofflieferanten, Einspeisetarife für die Erzeuger von Strom aus erneuerbaren Quellen und grüne Zertifikate.