In het specifiek programma Samenwerking worden zes gebieden geïdentificeerd waar een GTI bijzonder relevant zou kunnen zijn: waterstof en brandstofcellen, luchtvaart en luchtvervoer, innovatieve geneeskunde, ingebedde computersystemen, nano-elektronica en GMES (wereldwijde monitoring voor milieu en veiligheid).
Im Spezifischen Programm „Zusammenarbeit“ werden sechs Bereiche genannt, in denen JTI besonders gut eingesetzt werden könnten: Wasserstoff- und Brennstoffzellen, Luftfahrttechnik und Luftverkehr, innovative Arzneimittel, eingebettete Computersysteme, Nanoelektronik und die weltweite Umwelt- und Sicherheitsüberwachung(GMES).