Het DIS heeft een unieke technische opbouw met twee databanken, die logisch zijn gescheiden volgens hun toepassingsterrein, namelijk de douanesamenwerking in de EU (eerste pijler) en de intergouvernementele douanesamenwerking (derde pijler).
Das ZIS besitzt eine einzigartige technische Architektur. Diese setzt sich aus zwei Datenbanken zusammen, die nach Anwendungsbereich getrennt sind: eine für den Bereich der Zollzusammenarbeit auf EU-Ebene (d.h. im Rahmen des 1. Pfeilers) und eine für den Bereich der Zollzusammenarbeit auf Regierungsebene (d.h. im Rahmen des 3. Pfeilers).
