Als uitvoeringsmaatregel van Horizon 2020 moet BBI uiteraard beantwoorden aan de onderzoeks- en innovatieprioriteiten van Horizon 2020 die in het kader van de uitdagingen "Leiderschap op het gebied van ontsluitende en industriële technologieën" en "Voedselzekerheid, duurzame landbouw, marien en maritiem onderzoek en de bio-economie" zijn vastgesteld.
Es liegt auf der Hand, dass das Gemeinsame Unternehmen BBI als Durchführungsmaßnahme von „Horizont 2020“ mit den Forschungs- und Innovationsprioritäten von „Horizont 2020“ im Einklang stehen muss, die in den Einzelzielen „Führende Rolle bei grundlegenden und industriellen Technologien“ und „Ernährungssicherheit, nachhaltige Land- und Forstwirtschaft, marine, maritime und limnologische Forschung und Biowirtschaft“ verankert sind.