Het meest omstreden tijdens de onderhandelingen waren de toevoeging van "eco-innovatie" aan de thematische doelstelling versterking van onderzoek, technologische ontwikkeling en innovatie en de toevoeging van "het bevorderen van sociale inclusie door een betere toegankelijkheid van sociale, culturele en recreationele diensten" om bij te dragen tot sociale inclusie en bestrijding van armoede en discriminatie.
Die zusätzliche Aufnahme von „Öko-Innovationen“ zu den thematischen Zielen zur Stärkung von Forschung, technologischer Entwicklung und Innovation sowie die Hinzufügung der „Förderung der sozialen Eingliederung durch besseren Zugang zu sozialen, kulturellen und Erholungsdienstleistungen“, um so einen Beitrag zur sozialen Inklusion, zur Bekämpfung der Armut und gegen Diskriminierung zu leisten, wurde während der Verhandlungen am kontroversesten diskutiert.