In het tweede verslag over de tenuitvoerlegging van de verordening waarmee dit systeem wordt opgezet[30] informeert de Commissie over de problemen die er waren bij de tenuitvoerlegging van de verordening, zoals het beperkte aantal gemelde onregelmatigheden, problemen bij de interpretatie van rechtsbegrippen of de vrees van de lidstaten om te maken te krijgen met vervolging voor de nationale rechter door geregistreerde marktdeelnemers.
Im zweiten Bericht über die Anwendung der Verordnung zur Einführung dieses Systems[30], erläutert die Kommission die Probleme, auf die sie bei der Durchführung der Verordnung gestoßen ist, wie z.B. die geringe Zahl der gemeldeten Unregelmäßigkeiten, die Auslegungsprobleme bei Rechtsbegriffen oder auch die Befürchtung der Mitgliedstaaten, sich Klageverfahren seitens der registrierten Wirtschaftsteilnehmer vor den nationalen Gerichten auszusetzen.