In tegenstelling tot de gang van zaken bij de Structuurfondsen, waar de individuele projecten gewoonlijk op nationaal of zelfs regionaal niveau worden geselecteerd, wordt bij het Cohesiefonds een projectgewijze benadering toegepast.
Im Gegensatz zu den Strukturfonds, bei denen die Auswahl der Einzelprojekte in der Regel auf nationaler, ja sogar regionaler Ebene erfolgt, wird beim Kohäsionsfonds "von Projekt zu Projekt" entschieden. Jedes Projekt wird einzeln genehmigt.