Ook kan het aandacht besteden aan horizontale kwesties, zoals het geven van advies op het gebied van open onderzoek, onderzoek in samenwerkingsverband, wetgeving over intellectuele eigendom en concurrentie, technologie- en kennisoverdracht, toetsing aan internationale optimale werkmethoden, of het verrichten van anticiperend onderzoek om toekomstige doelen voor het EIT en de KIG's vast te stellen.
Die EIT-Zentrale kann sich so auch spezifischer horizontaler Fragen annehmen, wie z. B. Beratung zu Fragen der offenen Forschung, der gemeinsamen Forschung, der Gesetzgebung im Bereich des geistigen Eigentums und des Wettbewerbs, Technologie- und Wissenstransfer, Benchmarking anhand internationaler bewährter Verfahren, oder auch dadurch, dass sie Zukunftsstudien durchführt, um die künftige Marschroute für das EIT und die KIC zu ermitteln.