De uitvoeringsfase van BONUS wordt gespreid over ten minste vijf jaar, medegefinancierd door de deelnemende staten en de Unie tot alle door BONUS gefinancierde projecten volledig zijn afgesloten, op voorwaarde dat de Unie tot en met 2013 de nodige vastleggingen heeft gedaan en dat alle rapporteringsverplichtingen ten aanzien van de Commissie worden nagekomen.
Die Durchführungsphase von BONUS wird von den teilnehmenden Staaten und der Union über einen Zeitraum von mindestens fünf Jahren gemeinsam finanziert, bis der gesamte Lebenszyklus aller BONUS-Projekte abgeschlossen ist, sofern alle Unionsmittel bis 2013 aufgebraucht sind und die Berichtspflichten gegenüber der Kommission erfüllt sind.