De territoriale wateren worden beschouwd als de buitengrenzen van de EU. Schepen die van een haven in de ene lidstaat naar een haven in de andere lidstaat varen, verlaten dus technisch gezien het EU-douanegebied.
Die Hoheitsgewässer der Mitgliedstaaten gelten als Außengrenzen der EU, so dass zwischen EU-Häfen verkehrende Schiffe, formal gesehen, das Zollgebiet der EU verlassen.